У меня похожая проблема: крыша из деревянных лестниц. Одна горизонтальная линия не отображается. Если к невидимым блокам спереди (по направлению лестницы) прилепить еще блок - то они становятся видимыми. Про глюк с невидимыми блоками в FAQ читал, но в моем случае релог не помогает
Я подумал, что в FAQ написано про исчезающие чанки - это тоже видел пару раз.
Интересно узнать, как отображается дыра в моей крыше у других игроков... Если кто поможет, попозже выложу скриншот со своим домиком, чтоб найти его.
UPD: глюк пропал сам, видимо после нескольких релогов