Дело в том, что такие домики внутри пещеры будут выглядеть как просто домики в пещерах, ни у кого не будет ассоциации с тем, что это дома-грибы. Надо делать все таки гриб. Да, пусть снизу шапки будет не видно, но можно сделать разные по высоте грибы и с одного допустим будет видно шапку второго, ну или с самого спуска в пещеры будет видны шапки грибов, но это должна быть глубокая пещера ...
Вот примерно так я это представляю. На полублоки можно сажать грибы, по этому ими лучше облепить "столб", да и рельефности прибавляет. Нужно подглядеть как выглядят реальные, разные виды грибов и сделать их прототипы. Думаю это будет интересно выглядеть.
http://imgur.com/a/qy8CAЧто касается тыквенного дерева - будет эффектнее если оно будет жить на таких вот холмиках из камня, но окруженного кольцом , либо лавы, либо воды.