Это же шахты, а такая стратегия их рытья ""в глубь до упора а дальше в любом направлении" во многих гайдах, как эффективное средство поиска алмазов. Вот и делают так подальше от центра, что бы не упереться в заприваченные территории. Лаву так же водой заливают, для быстрого передвижения, из за чего при необходимости, ее фиг найдешь.
Хотя не уверен что это дело рук человека

Как то срубил дерево и обнаружил под ним как раз такую 1х1 яму. И вроде ведь нельзя за собой снизу дыру заткнуть и посадить дерево.